課程資訊
課程名稱
作物育種學研究法
Research Method in Crop Breeding 
開課學期
106-1 
授課對象
生物資源暨農學院  作物科學組  
授課教師
陳凱儀 
課號
Agron7006 
課程識別碼
621 M1350 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四3,4(10:20~12:10) 
上課地點
農藝304 
備註
乙組必修。星期四346789節上課。與胡凱康、董致韡、黃永芬合授
總人數上限:20人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1061Agron7006_1061 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

1. 分子標記
2. 基因組連鎖群圖譜分析
3. 數量性狀定位與分析
4. 應用於作物育種的高通量分子標記技術 

課程目標
以實際育種試驗研究工作內容為主軸, 配合最新發展的分子標記分析技術及生物資訊工具等育種資料之實務操作, 修課學生將具備從事現場育種工作的基礎.
 
課程要求
建議先修:統計應用軟體、數量遺傳學、植物基因體學。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
指定文獻 & 自編講義 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/14  課程介紹、植物基因體 DNA 抽取實驗 (陳凱儀) 
第2週
9/21  基因型定型分析實驗 (陳凱儀) 
第3週
9/28  遺傳圖譜建構基本慨念 (陳凱儀) 
第4週
10/05  非自交系親本的連鎖圖譜 (黃永芬) 
第5週
10/12  非自交系親本的連鎖圖譜 (黃永芬) 
第6週
10/19  QTL mapping (黃永芬) 
第7週
10/26  QTL mapping (黃永芬) 
第8週
11/02  SNP-based genome mapping (董致韡) 
第9週
11/09  Analyzing crop genomes (董致韡) 
第10週
11/16  Characterization of crop genomes and association study (董致韡) 
第11週
11/23  From GWAS to causal variants (董致韡)  
第12週
11/30  高通量 SNP 基因型分析平台 -ddRAD (胡凱康) 
第13週
12/07  GATK best practice workflow (胡凱康) 
第14週
12/14  R / Variant Annotation 解讀 VCF (胡凱康) 
第15週
12/21  Genetic distance and PCA (SNP) (胡凱康) 
第16週
12/28  Galaxy / Stacks 介紹與實作 (陳凱儀)